Die Organe der Erich-Gutenberg-Arbeitsgemeinschaft sind zum einen der Vorstand, zum anderen die Kommissionen, die für die Preisvergabe in der jeweiligen Kategorie zuständig sind.

Desweiteren hat die Erich-Gutenberg-Arbeitsgemeinschaft im Laufe der Jahre verdiente Persönlichkeiten zu Ehrenmitgliedern ernannt.